红白两色在日本文化中有着特殊的地位，白色象征着纯洁，红色象征着太阳。除了国旗，这两色还广泛应用于日本的其他事物中，比如神社建筑、相扑力士的腰带等。

那么，第三种颜色是什么呢？其实就是国旗底部的白色。在日本文化中，白色代表着“虚无”，即没有颜色、没有形状、没有界限的存在。这与日本人的审美观有关，他们崇尚自然、和谐，认为万物皆有灵，而“虚无”正是天地万物的本源。

因此，日本的“三色旗”其实并非真正意义上的三色，而是由红、白两色加上白色底布构成的。这三色所代表的意义也反映了日本文化中对纯洁、太阳和虚无的重视。