艾滋病感染初期，称为急性HIV感染，患者可能会出现类似流感的症状，包括发烧、喉咙痛、淋巴结肿大，以及皮疹。咽痛通常会在出现后的一到两周内缓解。

然而，在急性感染后，HIV可能进入潜伏期，在此期间患者可能没有任何症状。随着病毒的复制和免疫系统的进一步破坏，患者可能会进入艾滋病（AIDS）期。在艾滋病期，患者可能会出现各种机会性感染和肿瘤，包括口腔念珠菌感染和卡波西肉瘤，这些感染也可能导致咽痛。

艾滋病患者咽痛的持续时间取决于多种因素，包括：

如果不进行治疗，艾滋病患者咽痛可能会持续数周或数月。然而，通过抗逆转录病毒疗法（ART），可以控制HIV，并减轻或消除咽痛和其他症状。